个人简介

南方医科大学皮肤病医院皮肤性病研究所PI，生物信息平台负责人。香港中文大学基因组学与生物信息学硕士、化学病理学博士，曾供职于深圳华大基因研究院和香港中文大学化学病理系从事基因组学和功能元件的功能研究，多项成果发表在Genome Research、Nature Communication等。现主要负责生物信息中心高性能计算平台的运转和开展皮肤遗传、RNA与皮肤衰老的机制研究。先后主持国家自然科学基金项目2项，广州市科技计划项目1项，南方医科大学皮肤病医院人才启动项目1项。以通讯作者或第一作者发表SCI论文7篇；以共同作者在Nature Methods、Cell Research等期刊发表SCI论文12篇，累计影响因子约为130，总引用1000多次。

研究领域

  主要研究方向：1）以大规模生物信息数据分析为主要手段，结合分子生物实验研究非编码元件在干细胞稳态维持的功能及机制；2）基于高通量DNA测序技术的全新生物标志物发现及临床应用。主要学术业绩：通过整合多组学数据，开发新的数据分析方法，阐述非编码元件在转录和转录后调控的分子作用机制（Nucleic Acids Research，2017；Nature communications， 2019）；首次从全基因组水平研究H3K27ac组蛋白修饰水平紊乱引起肌肉干细胞稳态失衡，引起老年肌无力症（Aging cell, 2019）；开发PARMAP计算生物学框架，有效筛选临床菌株群中潜在耐药功能基因（Frontiers in Microbiology，2020）。

近五年承担的科研项目有：

1. RNA结合蛋白介导长链非编码RNA亚细胞定位的机制研究 (国自然青年基金,项目编号：31900447) ，主持，在研，25万，2020.01-2022.12;

2. 衰老过程中增强子调控细胞外基质（ECM）重塑影响表皮干细胞稳态的分子机制研究 (国自然面上基金，项目编号：32070792)，主持，在研，58万， 2021.01-2024.12；

3. 新、突发重大传染病病原体发现、溯源及智能预警预测系统研发（科技部重点研发，SQ2021YFC2300137），参与，在研，400万，2022.01-2024.12；

4. 基于转录组数据预测皮肤组织中细胞类群组成结构（南方医科大学皮肤病医院人才启动项目），主持，在研，50万，2019.01-2024.12；

5. 基于转录组数据预测皮肤组织中细胞类群组成结构（广州市科技局，202102020719），主持，在研，5万，2021.04-2023.03。

个人成果

近年来第一作者或通讯作者发表的代表性文章

1. Zhang, Y., Shi, Y., Lin, J., Li, X., Bin, Y., & Zhou, J. (2021). Immune cell infiltration analysis demonstrates excessive mast cell activation in psoriasis. Frontiers in Immunology, 4941.

2. Huang, H., Hu, Y., Huang, G., Ma, S., Feng, J., Wang, D., Lin, Y., Zhou, J.* and Rong, Z.*, 2021. Tag-seq: a convenient and scalable method for genome-wide specificity assessment of CRISPR/Cas nucleases. Communications biology, 4(1), pp.1-8.

3. Li, X., Lin, J., Hu, Y., & Zhou, J.^* (2020). PARMAP: A Pan-Genome-Based Computational Framework for Predicting Antimicrobial Resistance. Frontiers in microbiology, 11:578795. (Impact factor: 4.235, 2区)

4. Zhou, J. ^#, So, K.K. ^#, Yuan, J., Ding, Y, Chen, F., Huang, Y., Sun, H., and Wang, H. (2019) Elevated H3K27ac in aged skeletal muscle tissue drives a fibrogenic conversion of muscle satellite cells. Aging Cell. (Impact factor: 7.627, 1区)

5. Zhao, Y.^#, Zhou, J.^#, …, Sun, H., Wang, H. (2019) MyoD induced enhancer RNA interacts with hnRNPL protein via CAAA motif to activate target gene transcription during myogenic differentiation. Nature Communications. 10(1):5787. (Impact factor: 12.124, 1区)

6. Zhou, J. ^#, Huang, Y., Ding, Y., Yuan, J., Wang, H., Sun, H. (2018). lncFunTK: A toolkit for functional annotation of long noncoding RNAs. Bioinformatics, 1,  p2. (Impact factor: 4.531, 1区)

7. Zhou, J.^#, Zhang, S.^#, Wang, H., and Sun, H. (2017). LncFunNet: an integrated computational framework for identification of functional long noncoding RNAs in mouse skeletal muscle cells. Nucleic Acids Res 45, e108–e108. (Impact factor: 10.162, 1区)

专利成果

1. 数据采集、分析及报告生成一体化的遗传诊断系统, 国家发明专利, 2021.10 (申请号 202110595234.5) 第一申请人。